Основными задачами Управления являются выявление, пресечение и предупреждение правонарушений в области охраны окружающей природной среды, установление физических, юридических и должностных лиц, виновных в их совершении, обеспечение контроля за экологической безопасностью на территории города Москвы, взаимодействие с государственными природоохранными, санитарно - эпидемиологическими и другими правоохранительными и контролирующими органами.