Согласно п.2 Постановления Правительства РФ от 01.02.2006 N 54 "О государственном строительном надзоре в Российской Федерации" федеральным органом, исполнительной власти, уполномоченным на осуществление государственного строительного надзора, среди прочих, является Федеральная служба по экологическому, технологическому и атомному надзору.

Федеральная служба по экологическому, технологическому и атомному надзору имеет следующую внутреннюю организацию - центральный аппарат, территориальные органы и подведомственные организации.

Центральный аппарат состоит из руководства (руководителя, его заместителей, помощников руководителя) и управлений.
Основными сферами деятельности управлений центрального аппарата являются:
• Административное управление:
• Управление обеспечения разрешительной и надзорной деятельности (утверждено приказом Руководителя Службы № 501 от 06 июня 2006 г.);
• Финансовое управление (утверждено приказом Руководителя Службы № 620 от 22 июня 2006 г.);
• Управление государственной экологической экспертизы и разрешительной деятельности (утверждено приказом Руководителя Службы № 712 от 19 июля 2006 г.);
• Управление по регулированию безопасности атомных станций и исследовательских ядерных установок (утверждено приказом Руководителя Службы 984 от 16.12.2008 г.);
• Управление по регулированию безопасности объектов ядерного топливного цикла, ядерных энергетических установок судов и радиационно опасных объектов, надзору за учетом и контролем ядерных материалов и радиоактивных веществ и физической защитой (утверждено приказом Руководителя Службы № 733 от 22 сентября 2008 г.);
• Управление по надзору в горной, металлургической и нефтегазодобывающей промышленности (утверждено приказом Руководителя службы № 687 от 14 июля 2006 г.);
• Управление по надзору в химической и нефтеперерабатывающей промышленности (утверждено приказом Руководителя Службы № 503 от 06 июня 2006 г.);
• Управление энергетического и строительного надзора (утверждено приказом Руководителя Службы № 733 от 28 июля 2006 г.).
Территориальными органами являются:
• Межрегиональные территориальные управления по технологическому и экологическому надзору по федеральным округам ;
• Межрегиональные территориальные управления по надзору за ядерной и радиационной безопасностью;
• Межрегиональное территориальное управление по информационным технологиям и защите информации.
В Москве органом, осуществляющим строительный надзор является Комитет государственного строительного надзора г. Москвы - Мосгорстройнадзор, который является правопреемником по всем правам и обязанностям Инспекции государственного архитектурно-строительного надзора г. Москвы. Комитет государственного строительного надзора г. Москвы действует на основании Положения, утвержденного Постановлением Правительства г. Москвы от 2 мая 2006 г. N 311-П строительство.