Так как данная операция является разовой, то необходимо оформить с работниками допсоглашения к трудовому договору на выплату заработной платы неденежными средствами (ч. 2 ст. 131 ТК РФ). Если этого не сделать, компания не сможет производить подобные расчеты с персоналом даже при наличии заявлений работников.
В целях исчисления НДФЛ заработная плата, выданная работнику в натуральной форме, является одним из видов натурального дохода физического лица ( п. 2 ст. 211 НК РФ). В соответствии с п. 1 ст. 211 НК РФ при получении налогоплательщиком дохода от организаций и индивидуальных предпринимателей в натуральной форме в виде товаров (работ, услуг), иного имущества, налоговая база определяется как стоимость этих товаров (работ, услуг) иного имущества, исчисленная исходя из их цен, определяемых в порядке, аналогичном предусмотренному ст. 40 НК РФ. При этом в стоимость таких товаров (работ, услуг) включается соответствующая сумма налога на добавленную стоимость.

В учете будут сделаны следующие записи:
Дт 20(26,44) Кт 70 - 25 000,00 руб. – начислена заработная плата за январь;
Дт 70 Кт 68 - 3 250,00 руб. – удержан НДФЛ;
Дт 70 Кт 90.1 – 2 200,00 руб. – выдана з/п изделиями (4шт. по 550,00 руб.)
Дт 70 Кт 50 -19 650,00 руб. – выдана з/п денежными средствами (25 000,00 руб.-3 250,00 руб.-2 200,00 руб.)
Дт 90.3 Кт 68 - 335,59 руб. – начислен НДС с реализации изделий.
Для начисления заработной платы в натуральной форме необходима одна из ведомостей: расчетная (форма N Т-51) или расчетно-платежная (форма N Т-49). Унифицированные формы этих документов утверждены Постановлением Госкомстата России от 05.01.2004 N 1.
Для выдачи "натуральной" заработной платы можно воспользоваться ведомостью выдачи натуральной оплаты по форме N 415-АПК, утвержденной Приказом Минсельхоза России от 16.05.2003 N 750. Документ разработан для агропромышленных предприятий, однако может быть использован компаниями, не занятыми в сельскохозяйственном секторе. Главное - закрепить в учетной политике возможность использования подобного документа (образец заполнения аналогичной ведомости см. на с. 35). Кроме того, при получении сотрудниками продукции непосредственно на складе или в магазине используется накладная. В ней кладовщик (продавец) отражает, какой товар и в каком количестве получил работник.
Пленум Верховного Суда РФ в п. 54. Постановления от 17.03.2004 №2 разъяснил, что при разрешении споров, возникших в связи с выплатой работнику заработной платы в неденежной форме в соответствии с коллективным договором или трудовым договором, необходимо иметь в виду, что по смыслу статьи 131 Кодекса и статьи 4 Конвенции МОТ N 95 1949 г. об охране заработной платы (ратифицирована Указом Президиума Верховного Совета СССР N 31 от 31 января 1961 г.) выплата заработной платы в такой форме может быть признана обоснованной при доказанности следующих юридически значимых обстоятельств:
а) имелось добровольное волеизъявление работника, подтвержденное его письменным заявлением, на выплату заработной платы в неденежной форме. При этом статьей 131 ТК РФ не исключается право работника выразить согласие на получение части заработной платы в неденежной форме как при данной конкретной выплате, так и в течение определенного срока (например, в течение квартала, года). Если работник изъявил желание на получение части заработной платы в натуральной форме на определенный срок, то он вправе до окончания этого срока по согласованию с работодателем отказаться от такой формы оплаты;
б) заработная плата в неденежной форме выплачена в размере, не превышающем 20 процентов от начисленной месячной заработной платы;
в) выплата заработной платы в натуральной форме является обычной или желательной в данных отраслях промышленности, видах экономической деятельности или профессиях (например, такие выплаты стали обычными в сельскохозяйственном секторе экономики);
г) подобного рода выплаты являются подходящими для личного потребления работника и его семьи или приносят ему известного рода пользу, имея при этом в виду, что не допускается выплата заработной платы в бонах, купонах, в форме долговых обязательств, расписок, а также в виде спиртных напитков, наркотических, токсических, ядовитых и вредных веществ, оружия, боеприпасов и других предметов, в отношении которых установлены запреты или ограничения на их свободный оборот;
д) при выплате работнику заработной платы в натуральной форме соблюдены требования разумности и справедливости в отношении стоимости товаров, передаваемых ему в качестве оплаты труда, т.е. их стоимость во всяком случае не должна превышать уровень рыночных цен, сложившихся для этих товаров в данной местности в период начисления выплат.
Что касается налогового учета, то по мнению Минфина РФ
Финансовое ведомство разъясняет, что в соответствии со ст. 131 ТК РФ доля зарплаты, выплачиваемой в неденежной форме, не может превышать 20 процентов от начисленной месячной заработной платы. Поэтому если в трудовом договоре заработная плата разбита на несколько составляющих (должностной оклад, оплата аренды жилья, оплата авиабилетов для проезда работника к месту постоянного проживания и обратно), то расходы на оплату труда в неденежной форме могут быть учтены в размере, не превышающем 20 процентов от суммы заработной платы (Письмо Минфина России от 08.08.2007 N 03-03-06/2/149). Аналогичные выводы содержит Письмо УФНС России по г. Москве от 11.01.2008 N 21-08/001105@.