Федеральное казначейство в своей деятельности руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, международными договорами Российской Федерации, нормативными правовыми актами Министерства финансов Российской Федерации.

Основными нормативными актами являются Бюджетный кодекс РФ; Постановление Правительства РФ от 1 декабря 2004 г. N 703 “О Федеральном казначействе” и иные нормативные акты.