Если в состав вашей организации входят обособленные подразделения, то в целях налогообложения прибыли в части налога, зачисляемого в региональные бюджеты, по итогам каждого отчетного (налогового) периода вам необходимо, помимо налоговой базы по организации в целом, определять налоговую базу, приходящуюся на каждое обособленное подразделение и на головную организацию, исходя из доли прибыли, приходящейся на эти обособленные подразделения, определяемой как средняя арифметическая величина удельного веса среднесписочной численности работников (расходов на оплату труда) и удельного веса остаточной стоимости амортизируемого имущества этого обособленного подразделения соответственно в среднесписочной численности работников (расходах на оплату труда) и остаточной стоимости амортизируемого имущества, определенной в соответствии с пунктом 1 статьи 257 НК РФ, в целом по налогоплательщику (абз. 1 п. 2 ст. 288 НК РФ).

Напомним, что ставка налога на прибыль для зачисления в федеральный бюджет составляет 2%, а ставка налога на прибыль, зачисляемого в бюджет субъекта, равна 18% (п. 1 ст. 284 НК РФ).

При этом если налогоплательщик имеет несколько обособленных подразделений на территории одного субъекта РФ, то распределение прибыли по каждому из этих подразделений может не производиться. В этом случае определяется доля прибыли, приходящаяся на все подразделения, а налог уплачивается через одно из них. Причем налогоплательщик сам выбирает то обособленное подразделение, через которое он будет уплачивать налог в бюджет данного субъекта РФ, уведомив о принятом решении налоговые органы, в которых обособленные подразделения налогоплательщика состоят на налоговом учете.

Стоит иметь в виду, что субъектом РФ, в котором расположены обособленное подразделение или головной офис, для отдельной категории налогоплательщиков может быть установлена пониженная (до 13,5%) ставка налога на прибыль (абз. 4 п. 1 ст. 284 НК РФ).